加州大学圣地亚哥分校生物工程系研究生阶段开设有以下学位项目，分别是：生物工程硕士：为期1年。旨在为医疗和生物工程行业培养更多的设计与项目工程师。主要面向当今技术和专业需要提升的工程师，或对工程设计，开发，制造与管理感兴趣的学生。不需要撰写毕业论文。有兴趣继续攻读博士学位的学生可以考虑申请现在的理学硕士项目而不是工程硕士项目。
加州大学圣地亚哥分校生物工程本科专业
生物技术专业为学生在生物技术行业的各种职业生涯和在研究生院继续教育做好准备。课程具有强大的工程基础，重点在生物化学过程应用。它涉及生物化学和代谢，动力学，生物传输，生物系统，生物反应器，生物分离，组织工程和细胞生理学的互补领域等生物工程课题。在这些领域的教育使生物工程和物理化学原理应用于细胞和分子生物学，随之而来的是对人类健康有益的分子，细胞和组织的发展。
加州大学圣地亚哥分校生物工程本科专业课程设置
大一：
BENG 1：生物工程概论 (1学分)
CHEM 6A：普通化学I
CHEM 6B：普通化学II
CHEM 6C：普通化学III
CHEM 7L：无机化学实验室介绍
MAE 8： 工程分析的Matlab编程
MATH20A：科学和工程微积分
MATH20B：科学和工程微积分
MATH20C：微积分和科学与工程的解析几何或MATH31BH：荣誉多变量微积分
PHYS 2A：物理力学
PHYS 2B：物理- 电力和磁力
大二：
BENG 1：生物工程概论(1学分)
BENG 100：生物工程设计导论
BENG 130：分子物理化学
BILD 1：细胞
CHEM 140A：有机化学I
CHEM 140B：有机化学II
MATH 20D：微分方程导论 (必须在数学20D 之前的阶段130！)
MATH 20E：矢量微积分或数学31CH：荣誉矢量微积分
MATH 20F：线性代数或数学31AH：荣誉线性代数
PHYS 2C：物理- 流体，热力学和光学
PHYS 2CL：物理实验室 - 电和磁，波和光学 (2学分)
HSS：人文/社会科学学院将军Ed。培训班
大三：
BENG 103B：生物工程传质
BENG 123：系统生物学和生物工程
BENG 160：化学和分子生物工程技术
BENG 168：生物分子工程
BENG 187A：生物工程设计项目：规划 (1学分)
BENG 191：高级研讨会I：生物工程专业问题(2学分)
BIBC 100：结构生物化学
BIBC 102：代谢生物化学
BICD 100：遗传学
CENG 101A：流体力学入门
MAE 170：实验技术
